Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsnl1P62761 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms