Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms