Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bace1P56818 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms