Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms