Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms