Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FmodP50608 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms