Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tmod1P49813 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tmod1P49813 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tmod1P49813 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tmod1P49813 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tmod1P49813 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tmod1P49813 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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