Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb41P48193 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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