Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms