Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik2P39087 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik2P39087 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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