Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprkP35822 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms