Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BgnP28653 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BgnP28653 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BgnP28653 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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