Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CebpbP28033 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms