Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PparaP23204 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PparaP23204 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PparaP23204 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PparaP23204 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PparaP23204 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PparaP23204 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PparaP23204 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms