Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms