Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd48P18181 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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