Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
RhoP15409 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhoP15409 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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