Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms