Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lire1P11260 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lire1P11260 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms