Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.1 ms