Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms