Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01650 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01650 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01650 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01650 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01650 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01650 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01650 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01650 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01650 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01650 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms