Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffaO54786 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffaO54786 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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