Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms