Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FxnO35943 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FxnO35943 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FxnO35943 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FxnO35943 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FxnO35943 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FxnO35943 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FxnO35943 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FxnO35943 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FxnO35943 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms