Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops5O35864 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms