Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfil3O08750 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms