Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Barx2O08686 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Barx2O08686 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Barx2O08686 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms