Protein–RNA interactions for Protein: L7N479

Tcrg-C3, T cell receptor gamma, constant 3, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C3L7N479 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tcrg-C3L7N479 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tcrg-C3L7N479 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tcrg-C3L7N479 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tcrg-C3L7N479 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tcrg-C3L7N479 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tcrg-C3L7N479 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tcrg-C3L7N479 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tcrg-C3L7N479 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tcrg-C3L7N479 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tcrg-C3L7N479 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tcrg-C3L7N479 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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