Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8888J3QPX5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms