Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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