Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm11236J3QMS7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm11236J3QMS7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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