Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Gm28038F7BCN9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Gm28038F7BCN9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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