Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmod3E9QA62 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms