Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms