Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms