Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms