Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd1E9PZ26 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms