Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms