Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms