Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nlrc5C3VPR6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc5C3VPR6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms