Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2B9EJA2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms