Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Phf11bB4XVQ1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Phf11bB4XVQ1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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