Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnldc1B2RXZ1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnldc1B2RXZ1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnldc1B2RXZ1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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