Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms