Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms