Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms