Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms