Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms