Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm5640A3KG49 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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